一、区域发展重大问题

1、新疆全面建设小康社会的目标与途径

2、加快新疆工业化进程的对策

3、新疆非公有制经济发展

4、加快天山北坡经济带发展

5、乌鲁木齐大都市经济圈

6、生态建设、环境保护与区域可持续发展

7、重大工程建设的前期研究与可行性论证

二、产业结构调整与经济运行

1、依靠科技进步促进新疆产业结构的调整升级与优化

2、新疆农业投入体系

3、新疆资源开发中的税收政策

4、拓宽周边国家市场的思路与对策

5、新疆特色农业发展与畜牧业产业化

6、新疆棉花产业发展与市场开拓

7、新疆服务业与新产业开拓

三、经济体制改革与企业制度创新

1、现代市场体系与功能建设

2、财政结构调整与制度创新

3、产业发展与资本运营

4、社会保障体系建设

5、国有企业的战略性改组与改造

6、国有资产管理体制改革

7、新疆就业与再就业问题

四、科技发展与科技体制创新

1、科技体制改革与区域创新

2、新疆科技咨询业发展与中介组织建设

3、技术引进与技术创新

4、高新技术发展及产业化

五、软科学研究理论与方法

1、软科学研究理论探索

2、软科学研究方法技术的应用和创新